El modelado molecular permite a los científicos utilizar computadoras para visualizar moléculas, es decir, representar numéricamente estructuras moleculares y simular su comportamiento con las ecuaciones de la física cuántica y clásica.
El objetivo del modelado molecular es desarrollar un modelo de sistema lo suficientemente preciso como para que no sea necesario realizar experimentos físicos .
El modelado molecular se ha ampliado en las últimas décadas desde una herramienta para visualizar bases de datos tridimensionales .