La evolución molecular es el proceso de cambio en la composición de la secuencia del material genético en poblaciones de organismos. El material genético consta de ADN, ARN y proteínas a lo largo de generaciones. La revolución en la tecnología del ADN ha sido un avance importante debido a que la naturaleza misma del ADN permite que se utilice como un documento de historia evolutiva, las comparaciones en las secuencias de ADN de varios genes entre diferentes organismos pueden informarnos sobre las relaciones de los organismos que no pueden ser inferido correctamente de la morfología. Un problema claro es que el ADN en sí es un documento histórico disperso y fragmentario y tenemos que tener cuidado con los efectos de los cambios en el genoma que pueden sesgar nuestra imagen de la evolución del organismo.
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