La proteómica vegetal se ocupa del complemento completo de proteínas de las plantas, incluidas las modificaciones realizadas en un conjunto particular de proteínas. La proteómica es un estudio en profundidad de un proteoma específico, que incluye información sobre las proteínas y sus modificaciones y variaciones. La proteómica trabaja con los socios que interactúan y los miembros asociados a ella en una red secuencial.