El estudio del medio natural se conoce como biotecnología ambiental. El desarrollo, uso y regulación de sistemas biológicos para la remediación de ambientes contaminados y para procesos amigables con el medio ambiente también se conocen como biotecnología ambiental según la Sociedad Internacional de Biotecnología Ambiental. El uso óptimo de la naturaleza se denomina biotecnología ambiental. La biotecnología ambiental, una subdisciplina de la biotecnología, es la aplicación de la biotecnología utilizada para estudiar el medio ambiente natural. Es útil para tratar aguas residuales y prevenir la contaminación. La biotecnología ambiental es más eficiente en la limpieza de desechos que los métodos convencionales. La biorremediación es la aplicación más amplia empleada por los ingenieros ambientales para limpiar el medio ambiente. Agregan nutrientes al suelo en el sitio de desechos que estimulan la actividad de las bacterias o agregan nuevas bacterias al suelo que digieren los desechos y limpian el sitio. La biorremediación es un área interesante de la biotecnología ambiental; sus aplicaciones son amplias y confiables.