Revista de fisiología y patología vegetal

Desarrollo y validación de marcadores EST-SSR en Gymnema sylvestre R.Br.

Kuldeepsingh A. Kalariya, Lipi Poojara, Dipal Minipara, Parmeshwar Lal Saran, Ram Prasnna Meena, Sinora Macwan, Ponnuchamy Manivel

Conocida por sus propiedades antidiabéticas, la Gymnema sylvestre , perteneciente a la familia Asclepiadaceae, es originaria de los bosques del sur de la India. También se encuentra en África tropical y en Australia. Todas las partes aéreas de esta planta contienen alcaloides, flavonas y saponinas, pero las hojas se utilizan principalmente por sus propiedades medicinales. Se informa sobre la diversidad basada en perfiles morfológicos, anatómicos y quimioperfiles, y marcadores de ADN polimórfico amplificado aleatoriamente (RAPD) e Inter Simple Sequence Repeats (ISSR), sin embargo, la diversidad genética a nivel molecular a través de los marcadores más eficientes, las etiquetas de secuencia expresada-SSR (EST-SSR), es deficiente en esta planta. Se generó una gran cantidad de datos del transcriptoma y se identificaron 5276 loci SSR en este estudio. La frecuencia de SSR en Gymnema sylvestre fue de 1/12,16 kB. Las repeticiones AAG/CTT fueron casi diez veces mayores que las repeticiones CCG/CGG. Se sintetizaron un total de 40 pares de cebadores, y 27 de ellos dieron lugar a una amplificación polimórfica en 25 genotipos de G. sylvestre recolectados en diferentes partes de la India. Los genotipos DGS 16 y DGS 34 fueron los más disímiles. Este fue el primer estudio que reveló diversidad genética y altos polimorfismos en G. sylvestre con la ayuda de marcadores EST-SSR que tienen una tasa de transferencia más alta del 67,5%. Se informó de la distribución desordenada de genotipos del mismo estado en diferentes grupos, lo que puede deberse a que G. sylvestre es una planta medicinal importante que la gente ha utilizado desde la antigüedad y se presume que habría migrado a diferentes lugares.