Revista de ciencia veterinaria y diagnóstico médico

Análisis de grupos de tendencias basado en la base de datos de secuenciación profunda para explorar el mecanismo de respuesta de las células endoteliales de la vena umbilical porcina a la infección por el virus de la peste porcina clásica

Xiaocheng Gong, Xin You, Xuepeng Li, Aoxue Hu, Zhongxing Wu, Jun He y Pengbo Ning

Las células endoteliales son uno de los principales objetivos de la infección por el virus de la peste porcina clásica (CSFV, por sus siglas en inglés), que causa la peste porcina clásica (CSF, por sus siglas en inglés). Aunque la patogénesis de la CSFV se ha estudiado durante mucho tiempo, aún se necesita un nuevo método para dilucidar el mecanismo subyacente. El análisis genómico basado en la secuenciación profunda brinda la posibilidad de realizar estudios adicionales sobre el mecanismo de infección por CSFV. En este trabajo, se desarrollaron análisis de grupos de tendencias y análisis bioinformáticos para interpretar las respuestas genéticas significativas de las células endoteliales al CSFV. Se identificaron genes clave que contribuyeron a la infección por CSFV Shimen que difieren de la infección por CSFV C y el control. El análisis GO (ontología genética) y KEGG sugirieron que la infección por CSFV Shimen causó cambios en los procesos biológicos, como el secuestro citoplasmático de NF-kappaB, la regulación del proceso apoptótico y la vía de señalización del receptor tipo Toll 4. Además, se observó una respuesta significativa de la vía de señalización PI3K-Akt, la miocarditis viral, la vía de señalización de la prolactina, etc., durante la infestación por Shimen. El análisis de tendencias basado en la base de datos de secuenciación profunda de grupos de series obtuvo una mejor interpretación del virus de la PPC Shimen, que proporcionó información más valiosa para comprender el desarrollo de la PPC.