La determinación de la secuencia de aminoácidos de las proteínas, el estudio de los cambios de conformación de las proteínas y también el estudio de las moléculas complejas con cualquier otra molécula no peptídica es el análisis de la secuencia de proteínas. Los procesos celulares de un organismo vivo se conocen gracias al descubrimiento de la estructura y función de las proteínas, lo que permite a los investigadores desarrollar y diseñar objetivos farmacológicos. La espectrometría de masas y la degradación de Edman son los principales métodos para determinar la secuenciación de proteínas. Tienen la principal ventaja de seguir grandes cantidades de proteínas en paralelo, que además son muestras y reactivos rápidos, mecanizados, prácticos, profundamente delicados y ahorradores. En este punto, es una metodología prometedora con una amplia variedad de usos para la exploración clínica y experimental.